对发霉轻微的药材应先进行隔离，干燥后用毛刷将菌丝刷去，通常用软毛刷或抹布沾开水擦拭，亦可用水洗法、喷醋法处理。赤、白芍不宜用水洗法，应以湿布擦去霉点后再熏。砂仁、五味子可用喷醋法。吸潮性强的药材如甘草、黄芪等可用排风器吹去霉点。不便刷洗的，可混米糠簸动撞去菌丝，再用与除潮相同的方法处理。不过上述方法只适用于轻度发霉、内在尚好的药材，如严重发霉要予以报废。

发霉的中药饮片，首先要做的就是消灭霉菌。霉菌一般在温度50℃以上，遇60%左右的乙醇或低浓度的酸便失去活力，故灭菌的方法很多，但根据中药品种的性质差异而有所不同，常用的方法有：撞刷法、淘洗法、醋液擦霉法、酒洗去霉法、油擦法等。

撞刷法：此法适用于发霉不严重的药材，将之经过日晒或烘烤使之干透后，放人撞笼或麻袋、布袋内来回摇晃。通过互相撞击摩擦，可以将霉去掉。适宜采用撞刷除霉的药材有桂党参、田七、生地、巴戟天、续断、葛根、射干、干姜、百部、鸡骨草等。

沟洗法：此法适用于发霉后不易刷掉霉迹的药材。将发霉的药材放入盆内，加水搓洗或刷洗，去霉后，快速捞出晒干即可。发霉轻微的可用冷水，较严重的可用热水，快洗，不能久泡，以免影响气味质量。适宜淘洗去霉的中药材有明党参、贝母、白芨、天冬、生半夏、枯梗、黄精、何首乌、莪术、鸡血藤、天南星等。

醋液擦霉法：此法适用于本身味酸不能沾水的药材，首先将生了霉的药材刷去部分霉灰后，置容器内，加入20%至30%的醋拌匀闷润，待醋被吸尽后，用文火炒干，即可当醋炙品入药。例如，玄胡、青皮、甘遂、五味子等可用此法。

酒洗去霉法：此法适用于不能沾水，但色泽、质地容易变化的药材。首先将药材摊开、喷洒酒，不断翻动和搓擦，喷后闷放一至两小时，再摊开晾干。一般10千克药材用酒0.6至1千克。另有些长条状药材如人参生霉时，可用刷子沾酒刷去霉。大黄、熟地等酒制品也可用此法。

油擦法：此法适用于不能见热的药材。具体做法是用布沾上无异味的食用植物油，往药材上反复搓擦，即可除去霉迹，如附片等可用此法。